Die Hochschule ist im weithin bekannten Schwabenhaus in der Gartenstraße direkt am Neckar untergebracht. Das 1899 im Historismus- und Jugendstil erbaute Gebäude diente zunächst einer Studentenverbindung und später unter anderem als Max-Planck-Institut und Volkshochschule. Seit 1998 ist es Sitz der Hochschule, die 1945 in Esslingen gegründet wurde.
Die Nähe zur Eberhard-Karls-Universität Tübingen ermöglicht vielfältige Kooperationen, insbesondere mit dem Musikwissenschaftlichen Institut, den theologischen Fakultäten, dem Universitätsmusikdirektor sowie dem Evangelischen Stift, das zugleich Träger der Hochschule ist. Studierende nutzen universitäre Lehrangebote, während umgekehrt Gasthörerinnen und Gasthörer aus Theologie und Kirchenmusik an der Hochschule studieren.

Eine enge Zusammenarbeit besteht mit der Evangelischen Stiftskirchengemeinde, etwa in der Reihe Tübinger Motette, bei Vortragsabenden sowie beim Tübinger Orgelsommer. Alle zwei Jahre laden die Tage der Offenen Tür zahlreiche Besucher ein, die Hochschule kennenzulernen. Der 2000 gegründete Freundeskreis der Hochschule fördert gezielt Studierende.
Seit 2001 bereichert der Kinderchor Tübinger Neckarschwalben das musikalische Leben der Stadt. Die Hochschule pflegt zudem eine bundesweit einzigartige ökumenische Kooperation mit der Katholischen Hochschule für Kirchenmusik Rottenburg sowie weitere kirchliche Partnerschaften. Praxisnähe, pädagogische Ausbildung, individuelle Betreuung und eine bewusst evangelische Prägung kennzeichnen das Studienangebot.